──魔法。
それが現実の技術となってから一世紀弱。

魔法を保持・行使する「魔法師」の育成機関、
通称「魔法科高校」。
若い才能たちが日々研鑽に励むこの学園に
西暦2095年の春、とある少女が入学する。
才色兼備で完全無欠な優等生──
彼女の名は、司波深雪。
共に入学した兄・達也との仲睦まじい
スクールライフを夢見ていた深雪だったが
彼女の前には「一科生」と「二科生」──
優等生と劣等生の壁が立ちはだかり……?

優等生の妹と、劣等生の兄。
個性豊かなクラスメイトや
ライバルたちと繰り広げられる
青春スクールマギクス、ここに開幕！